1949年12月6日，云阳县和平解放，县域设5个区2个镇34个乡，采用保甲制。1951年4月，废除保甲制，乡镇保改称村，甲改称小组，城镇保改为居民段，甲改称居民小组。因民主建政调整区划，到1954年3月，全县有多达16个区，190个乡镇，其中包括5个乡级镇。1958年，推行“政社合一”人民公社体制，乡镇人民委员会取消，改称人民公社，村先改称区队，后改称大队，组改称生产队。

1978年，全县共有79个人民公社。

1982年，撤销各公社管理委员会，更名乡镇人民政府。

1984年，全县各大队、生产队更名。大队改称村民委员会或居民委员会，生产队改称村民小组或居民小组。

1991年，全县共有11个农村区，2个区级镇，2个乡级镇，78个乡。

1992年9月，撤销11个农村区公所，成立11个农村工作委员会，将78个乡、4个镇分别调整为24个镇、18个乡，其中新建20个镇、扩大13个乡镇，保留2个镇、7个乡。

1999年9月28日，云阳县人民政府迁新县城双江镇。

2001年11月，撤销11个农村工作委员会，区一级行政区划中止。

2004年2月4日，云阳县与周边区县边界勘定工作结束。云阳县有省界1条，县界4条，总长438.5千米，其中鄂渝线云阳利川段12.5千米、开县云阳段93.3千米、云阳奉节段150.8千米、云阳万州段130千米、云阳巫溪段51.9千米。

2006年，对全县镇乡进行合并调整，分为特大乡镇、较大乡镇、一般乡镇3类。

2007年，调整并村，同时增加社区居民委员会。

2008年10月，撤销双江镇，成立青龙街道、双江街道。

2010年11月24日，撤销人和镇、盘龙镇，分别设立人和街道、盘龙街道。

至2024年，云阳县辖38个乡镇、4个街道办事处，包括：青龙街道、双江街道、人和街道、盘龙街道、江口镇、南溪镇、凤鸣镇、高阳镇、平安镇、红狮镇、故陵镇、龙角镇、沙市镇、栖霞镇、黄石镇、巴阳镇、渠马镇、双土镇、路阳镇、鱼泉镇、宝坪镇、农坝镇、桑坪镇、云阳镇、云安镇、双龙镇、清水土家族乡、水口镇、蔈草镇、泥溪镇、养鹿镇、后叶镇、龙洞镇、堰坪镇、大阳镇、耀灵镇、洞鹿乡、上坝乡、新津乡、普安乡、石门乡、外郎乡。共100个社区，380个村。